Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBQ06643 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBQ06643 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBQ06643 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBQ06643 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBQ06643 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBQ06643 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBQ06643 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LTBQ06643 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBQ06643 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBQ06643 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBQ06643 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBQ06643 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBQ06643 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBQ06643 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBQ06643 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBQ06643 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBQ06643 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBQ06643 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBQ06643 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBQ06643 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBQ06643 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LTBQ06643 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBQ06643 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBQ06643 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBQ06643 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBQ06643 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBQ06643 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBQ06643 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBQ06643 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBQ06643 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBQ06643 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBQ06643 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LTBQ06643 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LTBQ06643 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LTBQ06643 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
LTBQ06643 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LTBQ06643 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LTBQ06643 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LTBQ06643 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LTBQ06643 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBQ06643 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBQ06643 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBQ06643 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBQ06643 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBQ06643 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBQ06643 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBQ06643 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBQ06643 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBQ06643 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBQ06643 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBQ06643 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBQ06643 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBQ06643 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBQ06643 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBQ06643 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LTBQ06643 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBQ06643 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBQ06643 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBQ06643 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBQ06643 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBQ06643 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBQ06643 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBQ06643 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBQ06643 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBQ06643 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBQ06643 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBQ06643 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBQ06643 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBQ06643 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBQ06643 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBQ06643 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBQ06643 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBQ06643 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBQ06643 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBQ06643 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBQ06643 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBQ06643 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LTBQ06643 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBQ06643 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBQ06643 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBQ06643 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBQ06643 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBQ06643 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBQ06643 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBQ06643 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBQ06643 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBQ06643 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBQ06643 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBQ06643 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBQ06643 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBQ06643 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBQ06643 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LTBQ06643 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBQ06643 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBQ06643 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBQ06643 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBQ06643 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBQ06643 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
LTBQ06643 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms