Protein–RNA interactions for Protein: Q01543

FLI1, Friend leukemia integration 1 transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLI1Q01543 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
FLI1Q01543 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FLI1Q01543 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms