Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOAP61586 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOAP61586 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOAP61586 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOAP61586 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOAP61586 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RHOAP61586 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOAP61586 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOAP61586 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOAP61586 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOAP61586 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOAP61586 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RHOAP61586 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOAP61586 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOAP61586 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOAP61586 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOAP61586 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOAP61586 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOAP61586 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOAP61586 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOAP61586 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOAP61586 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOAP61586 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOAP61586 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RHOAP61586 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOAP61586 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOAP61586 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOAP61586 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOAP61586 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOAP61586 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOAP61586 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOAP61586 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOAP61586 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RHOAP61586 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOAP61586 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOAP61586 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOAP61586 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOAP61586 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOAP61586 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOAP61586 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOAP61586 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOAP61586 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOAP61586 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RHOAP61586 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOAP61586 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOAP61586 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOAP61586 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOAP61586 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOAP61586 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOAP61586 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOAP61586 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOAP61586 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOAP61586 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOAP61586 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOAP61586 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOAP61586 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOAP61586 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOAP61586 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOAP61586 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RHOAP61586 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOAP61586 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOAP61586 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOAP61586 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOAP61586 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOAP61586 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOAP61586 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOAP61586 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOAP61586 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOAP61586 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOAP61586 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOAP61586 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOAP61586 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOAP61586 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOAP61586 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOAP61586 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOAP61586 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOAP61586 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOAP61586 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOAP61586 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RHOAP61586 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOAP61586 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOAP61586 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOAP61586 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOAP61586 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOAP61586 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOAP61586 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RHOAP61586 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOAP61586 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOAP61586 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOAP61586 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOAP61586 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOAP61586 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOAP61586 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOAP61586 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOAP61586 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOAP61586 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOAP61586 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RHOAP61586 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHOAP61586 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RHOAP61586 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms