Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERVPABLB-1P60509 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ERVPABLB-1P60509 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms