Protein–RNA interactions for Protein: P59036

LINC00310, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00310, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00310P59036 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00310P59036 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00310P59036 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms