Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RARSP54136 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RARSP54136 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RARSP54136 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RARSP54136 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RARSP54136 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RARSP54136 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RARSP54136 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RARSP54136 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RARSP54136 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RARSP54136 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RARSP54136 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RARSP54136 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RARSP54136 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RARSP54136 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RARSP54136 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RARSP54136 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RARSP54136 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RARSP54136 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RARSP54136 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RARSP54136 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RARSP54136 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RARSP54136 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RARSP54136 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RARSP54136 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RARSP54136 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RARSP54136 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RARSP54136 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RARSP54136 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RARSP54136 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RARSP54136 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RARSP54136 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RARSP54136 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RARSP54136 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RARSP54136 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RARSP54136 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RARSP54136 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RARSP54136 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RARSP54136 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RARSP54136 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RARSP54136 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RARSP54136 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RARSP54136 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RARSP54136 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RARSP54136 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RARSP54136 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RARSP54136 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RARSP54136 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RARSP54136 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RARSP54136 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RARSP54136 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RARSP54136 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RARSP54136 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RARSP54136 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RARSP54136 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RARSP54136 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RARSP54136 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RARSP54136 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RARSP54136 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RARSP54136 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RARSP54136 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RARSP54136 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RARSP54136 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RARSP54136 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RARSP54136 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RARSP54136 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RARSP54136 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RARSP54136 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RARSP54136 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RARSP54136 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RARSP54136 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RARSP54136 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RARSP54136 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RARSP54136 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RARSP54136 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RARSP54136 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RARSP54136 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RARSP54136 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RARSP54136 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RARSP54136 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RARSP54136 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RARSP54136 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RARSP54136 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RARSP54136 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RARSP54136 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RARSP54136 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RARSP54136 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RARSP54136 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RARSP54136 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RARSP54136 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RARSP54136 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RARSP54136 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RARSP54136 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RARSP54136 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RARSP54136 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RARSP54136 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RARSP54136 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RARSP54136 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RARSP54136 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RARSP54136 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms