Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRE11P49959 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRE11P49959 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRE11P49959 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRE11P49959 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRE11P49959 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRE11P49959 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRE11P49959 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRE11P49959 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRE11P49959 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRE11P49959 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRE11P49959 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRE11P49959 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRE11P49959 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRE11P49959 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRE11P49959 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRE11P49959 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRE11P49959 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MRE11P49959 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRE11P49959 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRE11P49959 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRE11P49959 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRE11P49959 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRE11P49959 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRE11P49959 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRE11P49959 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRE11P49959 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRE11P49959 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRE11P49959 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRE11P49959 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRE11P49959 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRE11P49959 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRE11P49959 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRE11P49959 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRE11P49959 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRE11P49959 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRE11P49959 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRE11P49959 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRE11P49959 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRE11P49959 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRE11P49959 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRE11P49959 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRE11P49959 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRE11P49959 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRE11P49959 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRE11P49959 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRE11P49959 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRE11P49959 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRE11P49959 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRE11P49959 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRE11P49959 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRE11P49959 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRE11P49959 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRE11P49959 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MRE11P49959 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRE11P49959 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRE11P49959 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRE11P49959 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRE11P49959 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRE11P49959 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRE11P49959 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRE11P49959 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRE11P49959 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRE11P49959 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRE11P49959 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRE11P49959 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRE11P49959 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRE11P49959 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRE11P49959 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRE11P49959 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRE11P49959 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRE11P49959 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRE11P49959 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRE11P49959 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRE11P49959 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRE11P49959 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRE11P49959 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRE11P49959 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MRE11P49959 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRE11P49959 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRE11P49959 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MRE11P49959 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRE11P49959 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRE11P49959 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRE11P49959 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRE11P49959 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRE11P49959 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRE11P49959 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MRE11P49959 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
MRE11P49959 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
MRE11P49959 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MRE11P49959 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MRE11P49959 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MRE11P49959 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRE11P49959 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRE11P49959 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRE11P49959 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRE11P49959 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRE11P49959 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MRE11P49959 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms