Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMUP48645 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMUP48645 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMUP48645 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMUP48645 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMUP48645 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMUP48645 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMUP48645 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMUP48645 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMUP48645 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMUP48645 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMUP48645 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMUP48645 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMUP48645 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMUP48645 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMUP48645 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMUP48645 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMUP48645 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMUP48645 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMUP48645 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMUP48645 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMUP48645 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMUP48645 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMUP48645 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMUP48645 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMUP48645 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMUP48645 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMUP48645 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMUP48645 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMUP48645 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMUP48645 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMUP48645 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMUP48645 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMUP48645 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMUP48645 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMUP48645 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMUP48645 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMUP48645 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMUP48645 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMUP48645 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMUP48645 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMUP48645 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMUP48645 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMUP48645 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMUP48645 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMUP48645 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMUP48645 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMUP48645 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMUP48645 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMUP48645 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMUP48645 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMUP48645 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NMUP48645 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMUP48645 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMUP48645 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMUP48645 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMUP48645 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMUP48645 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMUP48645 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMUP48645 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NMUP48645 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMUP48645 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMUP48645 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMUP48645 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMUP48645 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMUP48645 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMUP48645 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMUP48645 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMUP48645 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMUP48645 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMUP48645 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMUP48645 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMUP48645 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMUP48645 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMUP48645 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NMUP48645 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMUP48645 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMUP48645 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMUP48645 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMUP48645 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMUP48645 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NMUP48645 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMUP48645 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMUP48645 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMUP48645 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NMUP48645 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMUP48645 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMUP48645 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMUP48645 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMUP48645 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMUP48645 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMUP48645 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMUP48645 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMUP48645 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMUP48645 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMUP48645 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMUP48645 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMUP48645 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMUP48645 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NMUP48645 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms