Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIA4P48058 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA4P48058 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms