Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABRA2P47869 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms