Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHRNA4P43681 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHRNA4P43681 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms