Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
POLR2IP36954 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
POLR2IP36954 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms