Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPB2P35606 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPB2P35606 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPB2P35606 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPB2P35606 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPB2P35606 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPB2P35606 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPB2P35606 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPB2P35606 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPB2P35606 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPB2P35606 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPB2P35606 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPB2P35606 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPB2P35606 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPB2P35606 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPB2P35606 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPB2P35606 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPB2P35606 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPB2P35606 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPB2P35606 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPB2P35606 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPB2P35606 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPB2P35606 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPB2P35606 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPB2P35606 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPB2P35606 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPB2P35606 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPB2P35606 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPB2P35606 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPB2P35606 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPB2P35606 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPB2P35606 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPB2P35606 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPB2P35606 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPB2P35606 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPB2P35606 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPB2P35606 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPB2P35606 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPB2P35606 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPB2P35606 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPB2P35606 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPB2P35606 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPB2P35606 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPB2P35606 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPB2P35606 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
COPB2P35606 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPB2P35606 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPB2P35606 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPB2P35606 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPB2P35606 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPB2P35606 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPB2P35606 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPB2P35606 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPB2P35606 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPB2P35606 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPB2P35606 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPB2P35606 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
COPB2P35606 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPB2P35606 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPB2P35606 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPB2P35606 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPB2P35606 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPB2P35606 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPB2P35606 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPB2P35606 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPB2P35606 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPB2P35606 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPB2P35606 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPB2P35606 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPB2P35606 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPB2P35606 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPB2P35606 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPB2P35606 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPB2P35606 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPB2P35606 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPB2P35606 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPB2P35606 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPB2P35606 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COPB2P35606 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COPB2P35606 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COPB2P35606 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
COPB2P35606 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPB2P35606 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
COPB2P35606 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
COPB2P35606 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COPB2P35606 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COPB2P35606 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPB2P35606 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
COPB2P35606 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25■■□□□ 1.59
COPB2P35606 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPB2P35606 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COPB2P35606 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPB2P35606 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPB2P35606 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPB2P35606 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPB2P35606 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPB2P35606 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPB2P35606 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPB2P35606 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPB2P35606 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms