Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HSPA4P34932 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HSPA4P34932 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms