Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMA3P25788 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMA3P25788 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms