Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CBSLP0DN79 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CBSLP0DN79 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms