Protein–RNA interactions for Protein: P0CI26

TRIM49C, Tripartite motif-containing protein 49C, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49CP0CI26 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM49CP0CI26 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM49CP0CI26 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms