Protein–RNA interactions for Protein: P02649

APOE, Apolipoprotein E, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOEP02649 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOEP02649 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOEP02649 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOEP02649 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOEP02649 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOEP02649 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOEP02649 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOEP02649 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOEP02649 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOEP02649 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOEP02649 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOEP02649 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOEP02649 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOEP02649 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOEP02649 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOEP02649 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOEP02649 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOEP02649 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOEP02649 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOEP02649 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOEP02649 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
APOEP02649 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOEP02649 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOEP02649 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOEP02649 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOEP02649 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOEP02649 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOEP02649 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOEP02649 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOEP02649 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOEP02649 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOEP02649 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOEP02649 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOEP02649 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOEP02649 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOEP02649 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOEP02649 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOEP02649 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOEP02649 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOEP02649 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOEP02649 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APOEP02649 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOEP02649 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOEP02649 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOEP02649 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOEP02649 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOEP02649 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOEP02649 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOEP02649 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOEP02649 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOEP02649 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOEP02649 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOEP02649 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOEP02649 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOEP02649 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOEP02649 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APOEP02649 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOEP02649 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOEP02649 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOEP02649 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOEP02649 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOEP02649 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOEP02649 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOEP02649 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOEP02649 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOEP02649 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOEP02649 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOEP02649 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOEP02649 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOEP02649 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOEP02649 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOEP02649 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOEP02649 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOEP02649 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APOEP02649 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APOEP02649 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOEP02649 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOEP02649 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOEP02649 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOEP02649 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
APOEP02649 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOEP02649 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOEP02649 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOEP02649 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOEP02649 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOEP02649 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOEP02649 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APOEP02649 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOEP02649 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOEP02649 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOEP02649 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOEP02649 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOEP02649 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APOEP02649 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOEP02649 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOEP02649 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOEP02649 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOEP02649 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOEP02649 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOEP02649 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms