Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP9BO43861 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP9BO43861 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms