Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP8B1O43520 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP8B1O43520 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP8B1O43520 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms