Protein–RNA interactions for Protein: O14908

GIPC1, PDZ domain-containing protein GIPC1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1O14908 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GIPC1O14908 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GIPC1O14908 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms