Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L11C9JVI0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP17L11C9JVI0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms