Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACD1B0YJ81 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HACD1B0YJ81 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms