Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
A8MVJ9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
A8MVJ9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
A8MVJ9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
A8MVJ9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
A8MVJ9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
A8MVJ9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
A8MVJ9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
A8MVJ9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
A8MVJ9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
A8MVJ9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
A8MVJ9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
A8MVJ9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
A8MVJ9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
A8MVJ9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
A8MVJ9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A8MVJ9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A8MVJ9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A8MVJ9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A8MVJ9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A8MVJ9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A8MVJ9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
A8MVJ9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
A8MVJ9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A8MVJ9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A8MVJ9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
A8MVJ9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
A8MVJ9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A8MVJ9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A8MVJ9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A8MVJ9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
A8MVJ9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
A8MVJ9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
A8MVJ9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
A8MVJ9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
A8MVJ9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
A8MVJ9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
A8MVJ9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
A8MVJ9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
A8MVJ9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
A8MVJ9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
A8MVJ9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
A8MVJ9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
A8MVJ9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
A8MVJ9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
A8MVJ9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
A8MVJ9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
A8MVJ9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
A8MVJ9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
A8MVJ9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
A8MVJ9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
A8MVJ9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
A8MVJ9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
A8MVJ9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
A8MVJ9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
A8MVJ9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
A8MVJ9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
A8MVJ9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
A8MVJ9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
A8MVJ9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
A8MVJ9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
A8MVJ9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
A8MVJ9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
A8MVJ9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
A8MVJ9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
A8MVJ9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
A8MVJ9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
A8MVJ9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
A8MVJ9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
A8MVJ9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
A8MVJ9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
A8MVJ9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
A8MVJ9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
A8MVJ9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
A8MVJ9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
A8MVJ9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
A8MVJ9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
A8MVJ9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
A8MVJ9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
A8MVJ9 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A8MVJ9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
A8MVJ9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
A8MVJ9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
A8MVJ9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A8MVJ9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A8MVJ9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A8MVJ9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A8MVJ9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
A8MVJ9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A8MVJ9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A8MVJ9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
A8MVJ9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
A8MVJ9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
A8MVJ9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
A8MVJ9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
A8MVJ9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A8MVJ9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A8MVJ9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
A8MVJ9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
A8MVJ9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms