Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VWA3AA6NCI4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VWA3AA6NCI4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms