Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAP1LC3B2A6NCE7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MAP1LC3B2A6NCE7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms