Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 AC016526.4-201ENST00000636059 517 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AC025278.3-201ENST00000636139 796 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 HORMAD1-202ENST00000361824 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AC011525.2-202ENST00000590611 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 GRIK1-203ENST00000389125 3140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 TRAPPC2L-211ENST00000565504 3102 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 LINC00662-206ENST00000590523 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 TJP2-206ENST00000453658 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 FILIP1L-203ENST00000383694 3280 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 KCNMB3-203ENST00000392685 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 RPL10-218ENST00000618723 2210 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 RCBTB2-206ENST00000544904 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 ATG13-211ENST00000528494 2351 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 BTRC-202ENST00000370187 6134 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 HOXB13-201ENST00000290295 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 ANKRD30BP2-202ENST00000447861 3260 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 FO681491.1-201ENST00000623586 3260 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 SPHK2-208ENST00000599029 3085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AC095350.1-201ENST00000443685 1711 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AC009108.4-201ENST00000623284 2451 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AL807752.1-201ENST00000395082 1322 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 SLC25A13-202ENST00000416240 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 GNL3-201ENST00000394799 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 CDK2AP1-204ENST00000538446 1161 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AP001453.2-201ENST00000544553 391 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AC105133.1-201ENST00000559749 742 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 SALL1-204ENST00000566102 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 DMRTC1-201ENST00000595412 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 PACRG-AS3-204ENST00000620150 567 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 SLC37A3-203ENST00000447932 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 TRIM46-201ENST00000334634 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AP000897.1-201ENST00000584036 1613 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 SLC4A1AP-206ENST00000618046 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 PCDHGB8P-202ENST00000507007 2873 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 PCDHB7-201ENST00000231137 3765 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 HSPA8-222ENST00000534319 1884 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 MSR1-205ENST00000445506 1513 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 CASS4-202ENST00000434344 2888 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 MAP1S-202ENST00000544059 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 HTR3D-202ENST00000382489 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AC007622.2-202ENST00000546714 1680 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 PALM2-201ENST00000314527 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 RPUSD4-208ENST00000533628 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 IGHV1-45-201ENST00000390621 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 RPL19P20-201ENST00000415648 591 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 KCNMA1-AS1-201ENST00000426234 863 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NPIPB9F8W1W9 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms