Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 SHANK2-201ENST00000338508 7271 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 QRICH2-201ENST00000262765 5357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 TMCC2-208ENST00000545499 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AGAP6-203ENST00000618025 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 USP30-201ENST00000257548 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 POLA2-201ENST00000265465 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 NEK6-213ENST00000540326 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AFAP1L1-201ENST00000296721 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 VWA3B-221ENST00000614454 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 GRB10-202ENST00000357271 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 FMO3-201ENST00000367755 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AC016650.1-201ENST00000502834 708 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AP001360.1-203ENST00000524708 464 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 TNFSF13B-202ENST00000430559 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 ATIC-201ENST00000236959 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 HS6ST2-202ENST00000370836 4441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AL354704.1-201ENST00000629369 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 ALOXE3-201ENST00000318227 3053 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 RAP1A-201ENST00000356415 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 RAPGEFL1-202ENST00000456989 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 LINC01164-201ENST00000341866 3384 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 WDR70-201ENST00000265107 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AC020915.2-201ENST00000591325 4227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 NPR2-201ENST00000342694 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 ABCB8-222ENST00000542328 4371 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 HYOU1-217ENST00000612687 4360 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 FAM47DP-201ENST00000402340 3290 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 PACRG-AS1-201ENST00000626335 2192 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 LLGL2-205ENST00000577200 3192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 PEX11B-203ENST00000537888 1632 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 MAGED2-205ENST00000375060 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AL162591.1-201ENST00000424435 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 CDX2-201ENST00000381020 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 RBM33-207ENST00000401878 10149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AL157838.1-201ENST00000424252 2502 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 ARHGEF4-212ENST00000525839 3828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 RUBCNL-208ENST00000429979 3979 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 ZNF266-206ENST00000592292 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 BICRAL-203ENST00000614467 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 EME1-207ENST00000511648 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 LCMT2-201ENST00000305641 6957 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 MKL1-205ENST00000407029 4091 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 GABPB1-203ENST00000380877 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 LCE2D-201ENST00000368784 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 ZWINT-203ENST00000373944 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 TOMM5-203ENST00000401811 789 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 CDK2AP2P2-201ENST00000478512 367 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 TACC1-209ENST00000520611 1550 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 TJP2-209ENST00000539225 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 TARS2-214ENST00000606933 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
NICN1Q9BSH3 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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