Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
U3KQV3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
U3KQV3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
U3KQV3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
U3KQV3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
U3KQV3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
U3KQV3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
U3KQV3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
U3KQV3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
U3KQV3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
U3KQV3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
U3KQV3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
U3KQV3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
U3KQV3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
U3KQV3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
U3KQV3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
U3KQV3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
U3KQV3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
U3KQV3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
U3KQV3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
U3KQV3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
U3KQV3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
U3KQV3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
U3KQV3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
U3KQV3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
U3KQV3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQV3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQV3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQV3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQV3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQV3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQV3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQV3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQV3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQV3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQV3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQV3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQV3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQV3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
U3KQV3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
U3KQV3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
U3KQV3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
U3KQV3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
U3KQV3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
U3KQV3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
U3KQV3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
U3KQV3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
U3KQV3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
U3KQV3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
U3KQV3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
U3KQV3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
U3KQV3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
U3KQV3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
U3KQV3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
U3KQV3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
U3KQV3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
U3KQV3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
U3KQV3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
U3KQV3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
U3KQV3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
U3KQV3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
U3KQV3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
U3KQV3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
U3KQV3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
U3KQV3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
U3KQV3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
U3KQV3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
U3KQV3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
U3KQV3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
U3KQV3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
U3KQV3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
U3KQV3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
U3KQV3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
U3KQV3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
U3KQV3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
U3KQV3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
U3KQV3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
U3KQV3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
U3KQV3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
U3KQV3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
U3KQV3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
U3KQV3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
U3KQV3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
U3KQV3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
U3KQV3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
U3KQV3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
U3KQV3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
U3KQV3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
U3KQV3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
U3KQV3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
U3KQV3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
U3KQV3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
U3KQV3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
U3KQV3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
U3KQV3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
U3KQV3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
U3KQV3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
U3KQV3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
U3KQV3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
U3KQV3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms