Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNX10Q9Y5X0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX10Q9Y5X0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7 ms