Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX13Q9Y5W8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX13Q9Y5W8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SNX13Q9Y5W8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX13Q9Y5W8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX13Q9Y5W8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX13Q9Y5W8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX13Q9Y5W8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX13Q9Y5W8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX13Q9Y5W8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX13Q9Y5W8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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SNX13Q9Y5W8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX13Q9Y5W8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX13Q9Y5W8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX13Q9Y5W8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX13Q9Y5W8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SNX13Q9Y5W8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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SNX13Q9Y5W8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX13Q9Y5W8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX13Q9Y5W8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX13Q9Y5W8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX13Q9Y5W8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
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SNX13Q9Y5W8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SNX13Q9Y5W8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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SNX13Q9Y5W8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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SNX13Q9Y5W8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX13Q9Y5W8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX13Q9Y5W8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
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SNX13Q9Y5W8 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX13Q9Y5W8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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SNX13Q9Y5W8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX13Q9Y5W8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SNX13Q9Y5W8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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SNX13Q9Y5W8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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SNX13Q9Y5W8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX13Q9Y5W8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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