Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BP1Q9Y3L3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SH3BP1Q9Y3L3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms