Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPDR1Q9UM22 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPDR1Q9UM22 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPDR1Q9UM22 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPDR1Q9UM22 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPDR1Q9UM22 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPDR1Q9UM22 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPDR1Q9UM22 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPDR1Q9UM22 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPDR1Q9UM22 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
EPDR1Q9UM22 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms