Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RIMKLBQ9ULI2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIMKLBQ9ULI2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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