Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBE1Q9UJT0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms