Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SCP2D1Q9UJQ7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SCP2D1Q9UJQ7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms