Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHRNA9Q9UGM1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms