Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
CTDSP1Q9GZU7 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTDSP1Q9GZU7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms