Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM5Q9C035 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM5Q9C035 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms