Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SYT3Q9BQG1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SYT3Q9BQG1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms