Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PHOX2BQ99453 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PHOX2BQ99453 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms