Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUFY1Q96T51 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RUFY1Q96T51 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms