Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ZNF488Q96MN9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNF488Q96MN9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms