Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
JSRP1Q96MG2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
JSRP1Q96MG2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms