Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAPZA3Q96KX2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAPZA3Q96KX2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms