Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
GJD4Q96KN9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
GJD4Q96KN9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GJD4Q96KN9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms