Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SLC35A4Q96G79 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLC35A4Q96G79 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms