Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT7

ASIC4, Acid-sensing ion channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC4Q96FT7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ASIC4Q96FT7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ASIC4Q96FT7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms