Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
EDC3Q96F86 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDC3Q96F86 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDC3Q96F86 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms