Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ECHDC3Q96DC8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ECHDC3Q96DC8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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